近日,中国农业科学院哈尔滨兽医研究所在蓝舌病病毒基因组进化与宿主免疫互作机制方面取得新进展,揭示了高CpG的虫媒病毒规避哺乳动物宿主免疫压力的新机制,相关研究成果发表在《细胞报告(Cell Reports)》上。脊椎动物基因组中普遍存在CpG二核苷酸频率受抑制的现象。为适应宿主环境,多数哺乳动物专嗜病毒会模拟宿主的低CpG特征,而昆虫专嗜病毒则无此限制。然而,蓝舌病病毒(BTV)和流行性出血病病毒(EHDV)等多节段双链RNA虫媒病毒,却在基因组中保持较高的CpG含量。它们如何逃避哺乳动物的免疫抑制并实现有效感染,目前尚不明确。研究首次系统证实,哺乳动物宿主蛋白ZAP广泛抑制BTV和EHDV的复制,而对非虫媒传播的轮状病毒(RV)则无显著限制作用。该研究以BTV为模型,揭示了ZAP的双重限制机制:一方面,ZAP通过与真核翻译延伸因子1A结合,进而阻断病毒蛋白的翻译过程;另一方面,ZAP优先识别病毒基因组负链RNA,并介导其降解。值得注意的是,BTV基因组第五节段呈现低CpG特征,其编码的NS1蛋白通过竞争性结合病毒RNA,保护基因组免受识别与降解。提高该节段CpG频率后,突变病毒在体内外的复制能力均显著下降。该研究为基于CpG重编码策略开发新型减毒活疫苗提供了重要理论依据。哈兽研牛羊传染病创新团队与荷兰瓦赫宁根大学联合培养博士研究生邵冉和硕士研究生郗灿坤为论文的第一作者,哈兽研尹鑫研究员和荷兰瓦赫宁根大学Jelke J.Fros教授为通讯作者。该研究得到了国家自然科学基金和国家重点研发计划等项目资助。原文链接:DOI:10.1016/j.celrep.2025.116742
2026-01-09 16:19:36
有很多用户反馈:肉鸡在21日龄免疫新威灵(新城疫活疫苗VG/GA株)之后,原有的呼吸道症状会减轻甚至消失,而且在之后的十几天的时间内,鸡群更不容易生病。对于这种现象的一种解释是:原本的呼吸道症状和新城疫有关,这次免疫起到了紧急接种的作用。但实际上对鸡呼吸道进行病原学检测的结果显示:大多数时候并未检出新城疫病毒,而是检出了传染性支气管炎病病毒,低致病性禽流感病毒,支原体,或者一些细菌。那么为什么免疫了新城疫活疫苗后,鸡的呼吸道症状会减轻呢?以下一项研究似乎可以从一定程度上解释这种现象。本研究所采用动物为商品肉鸡,分别在1日龄免疫了新城疫活疫苗LaSota株或VG/GA株,在免疫后1天,3天和7天,分别检测脾脏和盲肠扁桃体中编码几种非特异性免疫相关蛋白的基因的复制量。这几种蛋白的名称和功能简介如下:Mx1:与GTP结合,并在其结合的状态下与病毒核酸相互作用,从而抑制病毒的复制和传播;IRF7:促进IFN(干扰素)的产生,促进炎性反应;ChIFN-α:鸡α干扰素,诱导抗病毒蛋白的表达,抑制病毒复制,调节免疫应答,诱导免疫细胞到感染部位,增强抗病毒防御机制;MDA5:识别病毒的RNA,诱导Ⅰ型干扰素(IFN)的产生;暴露出病毒CARD结构,进一步触发抗病毒免疫反应;PKR:能够被双链RNA激活,抑制病毒蛋白质合成,并通过调控自噬和激活NF-κB发挥抗病毒作用。以下是试验结果,数字单位为非免疫对照鸡只编码相应蛋白的基因复制量的倍数,带有*的,表示与非免疫对照鸡只对比差异显著。可以看出,在免疫新城疫活疫苗之后,编码几种非特异性免疫相关蛋白的基因的复制量大多呈现出不同程度的增加。对比LaSota组和VG/GA组:在脾脏多数基因的表达量类似,LaSota组中编码Mx1的基因复制量更高。但是在盲肠扁桃体,VG/GA组几乎全部编码5种蛋白的基因的复制量都显著高于LaSota组,而且在免疫后7天仍然保持在较高的水平。编码这几种蛋白的基因复制量增加即意味着这些蛋白的生产量也会同步增长,这几种蛋白的抗病原微生物作用是非特异性的,他们也会对传支病毒、禽流感病毒、支原体和细菌起到杀灭和抑制作用。从试验结果来看,VG/GA株的表现比LaSota株更好,在现场使用中,由于VG/GA株对呼吸道的刺激远比LaSota株弱,对于已经表现出轻微呼吸道症状的鸡群,免疫VG/GA株也要安全得多。向下滑动查看参考文献Hassanin O, Abdallah F, Ali HA, AlGabr N, Mohamed MHA. Different kinetics of chicken interferon-alpha signalling transduction responses following immunization of broiler chickens with different Newcastle disease virus vaccines and infection with virulent genotype VIId strain. Avian Pathol. 2021 Feb;50(1)
2025-12-10 15:29:27
环指蛋白4(RNF4)是一种转录因子,在小鼠的睾丸中表达很高,可与雄激素受体互作。有研究者研究显示,RNF4蛋白作为一种转录协调子,在颗粒细胞、卵细胞及精细胞的发育过程中发挥着重要的调控作用。因此选择RNF4做为影响繁殖性状的候选基因。1 材料与方法1.1 材料猪的耳组织统一放在-20℃保存备用。1.2 方法1.2.1 引物的设计与合成  根据RNF4 基因DNA序列设计引物,退火温度为59.1℃。1.2.2 PCR扩增  PCR扩增后,可见937 bp的清晰目的条带。1.2.3 限制性内切酶酶切(RFLP)  PCR产物经内切酶酶切后,观察其分型结果。2 结果与分析2.1 猪RNF4基因的多态位点检测当多态位点为TC基因型时,可见3个片段(937 bp+545 bp+392 bp);当多态位点为TT基因型时,可见一个片段(937 bp)(图1)。猪RNF4基因SacII酶切分型结果图1  猪RNF4基因SacII酶切分型结果2.2 猪RNF4基因的基因型和等位基因的频率分布发现RNF4基因经过SacII酶切后,在三个猪群中,C等位基因占优势(表1)。2.3 猪RNF4基因三个基因型与猪所有胎次产仔数性状的关联分析通过在淮猪新品系Ⅱ猪群体中分析发现,CC型个体的所有胎次产仔数显著高于TT型个体1.044头(P<0.05),C等位基因为优势等位基因。详见表2。3 讨论RNF4基因在颗粒细胞、卵细胞及精细胞的发育过程中发挥着重要的调控作用,并发现,RNF4基因的CC基因型在所检测的3个猪群中占优势,这与其他研究者的结果是一致的。所以,在今后的猪的选育初期,可以参考选择RNF4基因的CC型个体作为一个选留参数,以期提高猪的产仔数。
2025-12-04 10:14:11
摘要基因定点敲入技术是基因工程和基因治疗的核心工具,旨在避免传统随机整合方法的不可控性及异质性等问题,但是在实际的应用过程中却长期受编辑过程中的脱靶活性和低效性的限制。近年来,位点特异性重组酶系统(如Bxb1整合酶)和可编程核酸酶系统(如CRISPR-Cas9)的发展显著提升了基因敲入的精确性与效率。特别是Cas9-Bxb1整合酶系统的出现,实现了5~43 kb大片段DNA在基因组安全港位点的靶向整合,为功能蛋白生物合成、疾病模型构建、基因功能研究和临床治疗提供了突破性平台。本文系统综述了位点特异性重组酶在精准医学和合成生物学中的应用研究进展。传统的基因敲入方法主要依赖质粒的随机整合或同源重组实现外源DNA的敲入,相较于同源重组方法,随机整合方法对技术的要求较低且耗时较短,因其易于操作性被广泛使用。然而,随机整合在使用过程中却被发现效果不佳,主要是因为整合位点的不可控导致转基因敲入的异质拷贝数,或敲入位置相关的高表达克隆变异,包括转基因拷贝数的丢失、染色体重排和因表观遗传调控而造成的克隆稳定性降低,进而导致后续需要繁琐的筛选流程来确定稳定和高表达克隆。研究发现,转座酶、逆转录病毒、慢病毒载体在染色体整合方面很有效,被广泛应用于基因组工程以提高敲入效率。然而,这些方法都有各自的局限性。例如,基于慢病毒载体技术尽管有效负载能力(18 kb)非常出色,但却具有遗传毒性和免疫原性。逆转录病毒和慢病毒载体倾向于整合附近的转录单位。更重要的是,上述方法均为随机整合,无法精确控制敲入拷贝数,因而难以避免异质性表达的问题。睡美人(sleepingbeauty)和piggyBac这两个最为常见的DNA转座子系统也因缺乏可编程性及在基因组中的“跳跃”特性,成为开发精准基因编辑转座子系统的重大障碍,虽然经过大量的工程改造及与CRISPR系统结合使转座子系统具有靶向性,但是脱靶活性仍然显著。在基因组编辑领域,如何实现大型DNA构建体的高效精准整合一直是亟待解决的关键科学问题。近年来,随着位点特异性重组酶系统(site-specific recombinase,SSR)及核酸酶系统(site-specific nuclease, SSN)的深入研究及应用,大基因片段整合效率得到显著提升。目前,这两种方法在基因敲入方面都具有很大应用潜力。值得关注的是,最近研究者开发了一种新的工具,将RNA引导的Cas9和位点特异性整合酶Bxb1结合起来,成功实现了5~43 kb大片段DNA的定向整合,这一技术突破不仅为构建稳定转基因细胞系提供了新工具,更在基因治疗和生物制药领域展现出广阔的临床应用前景和商业价值。本文也将就这一新技术的发展略作介绍和讨论。1 技术原理与发展脉络基因编辑领域近年来迎来了革命性的技术突破——Cas9-Bxb1整合酶联合工具箱的诞生。该系统将CRISPR-Cas9系统的可编程靶向能力与Bxb1整合酶的大片段DNA精准整合特性相结合,实现了基因组编辑从“小修小补”到“整体替换”的跨越。Bxb1作为一种来源于耻垢分枝杆菌的丝氨酸重组酶,通过识别特定的附着位点(attP/attB)实现DNA片段的不可逆单向整合,其最大优势在于近乎零脱靶活性(伪attP位点识别率<0.1%)及高达60%的整合效率。然而传统Bxb1系统存在可编程性不足的缺陷,需预先在基因组中设置识别位点,限制了广泛应用。为突破这一限制,两大研究团队分别提出了创新性解决方案:

1.1 twinPE+Bxb1系统(哈佛大学刘如谦团队):采用两步法策略。首先利用双pegRNA引导的先导编辑器(twinPE)在基因组特定位点(如安全港相关基因座)精准插入attB识别序列;随后通过Bxb1整合酶介导携带attP位点的大片段供体DNA(可达5.6 kb)的定向整合。这一策略在Hunter综合征模型治疗中成功修复了IDS基因与假基因IDS2之间的40 kb致病性倒位,修复效率达9.6%。1.2 PASTE系统(麻省理工学院Gootenberg团队):创造性地将nCas9切口酶、逆转录酶(RT)与Bxb1整合酶融合为单一蛋白复合物(SpCas9-RT-Bxb1),并设计改造的atgRNA引导系统。该方案能在单步反应中实现36 kb超大DNA片段在人类细胞系、原代T细胞和非分裂肝细胞中的高效整合(效率50%-60%)。其独特优势在于不依赖DNA双链断裂(DSB)修复途径,避免了由此引发的染色体结构异常风险。2 效率突破与机制解析检验尽管早期Cas9-Bxb1系统展现出巨大潜力,其整合效率仍难以满足临床应用需求。2024年,刘如谦团队通过噬菌体辅助连续进化(PACE)技术对Bxb1进行定向改造,获得了革命性突破——evoBxb1与eeBxb1两种高效变体。2.1 进化工程提升整合效率2.1.1 PACE进化平台:利用噬菌体生命周期与Bxb1酶活性的偶联,构建了“酶活性-噬菌体增殖”的正向选择系统。通过在数百代进化中施加选择性压力,筛选获得活性提升的突变体。2.1.2 evoBxb1变体:初期进化获得的突变体,在人类细胞中整合效率较野生型Bxb1提高2.7倍。机制研究表明,其活性提升主要源于DNA结合域(DBD)的S37P和R45Q突变,增强了与att位点的亲和力。2.1.3 eeBxb1变体:在evoBxb1基础上引入组合突变(包括催化结构域的D81G和E142K),形成最终的高效版本。该变体在HEK293T、N2a和HuH7细胞系中的平均整合效率达30%,较野生型提高4.2倍;在原代人成纤维细胞的COL7A1和FANCA基因座中分别实现30%和18%的整合率,较前一代PASSIGE系统提升14倍。2.2 结构机制与AI预测eeBxb1超高活性的结构基础一度是未解之谜。由于Bxb1完整多聚体结构尚未解析,研究团队采用 AlphaFold2人工智能预测模型,揭示了关键突变位于酶-DNA相互作用界面:2.2.1 D81G突变:缓解催化口袋的空间位阻,促进重组反应中DNA链转移2.2.2 E142K突变:增强与DNA磷酸骨架的静电相互作用,稳定过渡态构象这些预测通过分子动力学模拟得到验证,为后续理性设计提供了新思路。3 疾病治疗和过表达细胞株构建领域的应用突破Cas9-Bxb1工具箱的高效性和精准性为多种难治性遗传病提供了全新的治疗思路,尤其在传统方法难以应对的大片段基因替换场景中展现出独特价值。3.1 遗传病治疗新模式3.1.1 Cas9-Bxb1系统通过将完整健康基因靶向整合至基因组安全港(如AAVS1位点)或原位替换,实现“一药治百突变”的突破。Prime Medicine公司基于此技术的慢性肉芽肿病(CGD)疗法已获FDA临床试验批准,成为全球首个进入临床阶段的先导编辑疗法。3.1.2 肝脏遗传病模型:在HuH7肝细胞中,eePASSIGE介导的凝血因子IX(F9)基因整合后,表达量达野生型系统的8.7倍。白蛋白启动子驱动的hFIX分泌成功模拟生理性表达模式,为血友病B提供了符合生理调节的治疗方案。3.2 细胞疗法革新CAR-T细胞制备中,慢病毒随机整合导致的插入突变和表达异质性是长期痛点:3.2.1 原代T细胞精准编辑:PASTE系统在T细胞的TRAC位点实现PD1抗性基因(>10 kb)的定点整合,效率>50%。对比传统方法,修饰后的CAR-T细胞展现更持久抗肿瘤活性,且未检测到染色体异常。3.2.2iPSC疗法标准化:STRAIGHT-IN技术结合Bxb1与Cre重组酶,在人类诱导多能干细胞(iPSC)中实现170 kb超大片段的无痕整合。通过多轮重组酶处理,成功构建携带多基因回路的“通用型”iPSC库,为再生医学提供标准化细胞源。3.3 复杂结构变异修复传统基因编辑技术难以处理的染色体倒位/重复疾病迎来新希望:3.3.1 Hunter综合征治疗突破:通过twinPE在X染色体q28区同步安装反向attB/attP位点,Bxb1介导40 kb致病区域倒位修复,成功恢复IDS基因功能。该策略效率达9.6%,远高于传统HDR方法(<0.1%)。3.3.2 大片段缺失疾病模型:在小鼠受精卵中利用Cas9-Bxb1工具箱成功构建DMD基因外显子50缺失模型,为杜氏肌营养不良研究提供精准动物模型。3.3.3 大片段多基因过表达稳转CHo细胞株的构建突破:辉瑞公司开发了一种基于Bxb1重组酶的高保真双位点整合系统,创建了CHO dBxb1宿主细胞系,能够在更短时间生产稳转细胞系。4 前沿拓展与交叉创新Cas9-Bxb1工具箱的应用已超越传统基因治疗范畴,在合成生物学、微生物组工程和农业育种等领域展现出强大生命力。4.1 合成生物学应用4.1.1 基因回路构建:在CHO细胞中利用Big-IN技术实现143 kb人工基因回路的定点整合,包含诱导型启动子、反馈抑制模块和分泌信号肽。该工程细胞株的单克隆表达变异系数(CV)<15%,远低于随机整合(CV>50%),大幅提升重组蛋白生产稳定性。4.1.2 染色体尺度工程:英国SynHG计划结合Cas9-Bxb1与人工智能设计,构建抗病毒染色体。通过在特定位点整合CRISPR阵列和抗性基因簇,实现染色体水平的抗病毒功能。4.1.3 功能蛋白生物合成工程:杭州景杰生物科技利用Bxb1整合酶开发了识别H3 K18la兔单克隆抗体的稳转细胞株。他们首先通过phiC31整合酶构建了带有Bxb1整合位点的CHO-S稳转细胞工程株CHO-JJ-9,然后再通过Bxb1整合酶将抗体基因转入该工程株。这种方法大幅缩短了稳转细胞株构建时间,提高了成功率,且获得的稳转细胞株都是高产量;辉瑞公司利用双位点Bxb1-RMCE构建的过表达细胞株双抗生产(Knob-into-hole)表达量11g/L,纯度98.8%。4.2 微生物组工程4.2.1 微生物基因簇克隆:清华大学朱听团队开发的CATCH技术(Cas9-assisted targeting of chromosome segments)将体外Cas9切割与Bxb1整合结合,实现100 kb微生物基因簇的高效克隆。该方案在8小时内完成靶向切割与Gibson组装,大幅加速天然产物生物合成研究。4.2.2细菌工厂优化:丹麦技术大学开发的pAblo·pCasso工具包将dCas9-Bxb1融合体与碱基编辑器偶联,在革兰氏阴性菌中实现可逆DNA编辑。通过精准调控甲羟戊酸合成途径,工程菌的番茄红素产量提升7倍。4.3 农业育种创新4.3.1 多基因叠加育种:在玉米中利用Bxb1介导的多基因叠加,实现抗虫(Bt基因)、抗除草剂(EPSPS)和耐旱(HVA1)性状的同步整合。对比传统杂交育种,周期缩短3代,且无载体骨架残留。4.3.2作物代谢通路重构:通过PASTE系统在水稻基因组“安全港”OsROC5位点整合25 kb维生素A合成通路,黄金稻品系β-胡萝卜素含量达6.5 μg/g,为解决维生素A缺乏症提供新方案。5 现存挑战与未来方向尽管Cas9-Bxb1工具箱取得显著进展,其临床转化仍面临多重挑战,亟需多学科协同创新突破关键技术瓶颈。5.1 递送技术瓶颈5.1.1 体内递送障碍:大分子编辑器(SpCas9-RT-Bxb1>200 kDa)难以通过AAV载体(容量<4.7 kb)递送。刘如谦团队正探索 工程化病毒样颗粒(eVLP)解决方案:5.1.2 非病毒递送策略:IDLV(整合酶缺陷型慢病毒载体)在原代成纤维细胞中实现eePASSIGE组分的高效共递送,整合效率达30%。脂质纳米颗粒(LNP)包封的eeBxb1 mRNA在小鼠肝脏显示特异性表达,为体内应用提供可能。5.2 脱靶风险控制5.2.1 脱靶整合检测:开发新型脱靶分析工具DISCOVER-Seq+,通过监测MRE11蛋白在DNA断裂位点的聚集,实现全基因组范围内脱靶事件的灵敏检测。在eePASSIGE处理的细胞中,脱靶整合率<0.004%。5.2.2正交整合酶开发:Durrant团队从微生物组筛选发现新型重组酶Pc01与Enc9,其att位点与哺乳动物基因组同源性更低。在小鼠实验中,Pc01的脱靶率仅为Bxb1的1/20,为高安全性基因治疗提供新工具。6 结论Cas9-Bxb1整合酶联合工具箱通过融合CRISPR的可编程性和丝氨酸重组酶的高效性,突破了传统基因编辑在大片段精准整合中的技术瓶颈。从twinPE+Bxb1到eePASSIGE的技术跃迁,标志着该领域从概念验证走向临床转化的关键转折。随着递送技术、脱靶控制及伦理框架的同步完善,该技术有望在遗传病根治、细胞疗法升级、农业创新育种和合成生物学等领域释放更大潜力。原文链接:https://mp.weixin.qq.com/s/RkcJL5flbPddCiXvjPCYEg
2025-10-24 11:29:17
近日,中国农业科学院哈尔滨兽医研究所成功构建一种多功能纳米平台 CeO₂/3TT@NP-RVG,该平台能够穿越血脑屏障并实现神经元靶向递送,在脑炎的精准成像与治疗方面展现出巨大的应用潜力。相关研究成果于近日发表在《生物材料(Biomaterials)》上。脑炎是一种危及生命的神经系统疾病,具有高死亡率和严重的长期神经后遗症。目前,由于缺乏针对潜在病理机制的有效治疗手段,加之血脑屏障(BBB)的阻碍,现有临床干预多局限于症状缓解,难以有效抑制铁死亡及活性氧(ROS)介导的神经毒性。该研究提出了融合分子机制干预与精准成像的诊疗一体化新策略,创新性地构建了CeO₂/3TT@NP-RVG纳米平台。该平台能够实现深组织分辨率下的脑炎实时成像,协同清除ROS、抑制炎症因子(TNF-α、IFN-β),并通过泛素化介导下调POR-ACSL4-LPCAT3通路以抑制铁死亡,从而显著提高脑炎小鼠模型的生存率。牛羊传染病创新团队博士后王骞若为论文的第一作者。哈尔滨兽医研究所尹鑫研究员、吉林大学李媛媛教授、香港中文大学(深圳)唐本忠院士为论文的共同通讯作者。该研究得到国家重点研发计划(2022YFE0140700)、吉林省科技发展计划(20240101266JC)及广东省重点领域研发计划(2024B0101040001)等项目资助。原文标题及链接:“Inflammation-Targeted Nanoplatform: NIR-II Imaging-Guided Encephalitis Suppressing by Dual Antioxidant-Ferroptosis Action”https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S014296122500660X?dgcid=coauthor
2025-10-13 14:56:10
摘要小干扰 RNA 通常通过序列特异性降解 mRNA 来阻断基因表达。我们此前开发了一种重组腺病毒,该病毒由 U6 启动子驱动,表达三种靶向口蹄疫病毒(FMDV)的短发夹 RNA(Ad-3siRNA)。这些短发夹 RNA 对 FMDV 表现出快速的抗病毒作用。在此,我们研究了 Ad-3siRNA 与口蹄疫灭活疫苗联合使用的免疫刺激效果。通过将 Ad-3siRNA 与口蹄疫(FMD)灭活疫苗联合使用,我们观察到在接种后 1 周内保护效力增强,且小鼠从接种后 1 周开始中和抗体水平升高。此外,接种疫苗和 Ad-3siRNA 联合制剂的猪,接种后 7 周内体液免疫显著增强。Ad-3siRNA可诱导小鼠产生多种细胞因子,如IFN-α、IFN-γ、IL-12、IL-6、IL-15和IL-18。总之,我们证明了 Ad-3siRNA 是一种通过人腺病毒载体递送的新型免疫刺激 RNA,与 FMD 灭活疫苗联合使用时可增强保护作用和体液免疫。Ad-3siRNA在其他病毒性疾病中的应用及进一步的机制研究尚需进一步探索。1. 前言RNA干扰(RNA interference,RNAi)技术是通过小分子干扰RNA(small interfering RNAs,siRNA)或短发夹RNA(short hairpin RNAs,shRNA)引导的序列特异性 mRNA 降解来抑制基因表达。已有报道称RNAi应用存在非特异性 “脱靶效应”。免疫刺激性 siRNA(isiRNA)除了抑制靶标表达外,还能触发先天免疫反应。免疫激活通过视黄酸诱导基因 I(RIG-I)、黑色素瘤分化相关蛋白5(MDA-5)、蛋白激酶 R(PKR)、toll样受体(TLR)3或TLR7/8发生。最近,有报道称isiRNA具有抗病毒和抗肿瘤潜力。此外,isiRNA作为疫苗佐剂已被研究,可增强体液和细胞免疫。口蹄疫(FMD)是一种急性传染性疾病,可感染牛、猪、羊和山羊等偶蹄动物。导致其发热,口腔、舌头、乳头和蹄部起水泡。口蹄疫病毒(FMDV)是一种单链正链 RNA 病毒,属于小RNA病毒科口蹄疫病毒属,有7个血清型和 60 多个亚型。目前使用灭活疫苗预防 FMDV 传播,但是,应用过程中应根据血清型和亚型选择不同的疫苗株。此外,使用现有的FMD疫苗形成抗体以控制FMD的爆发是一个漫长的过程。因此,在疫苗诱导的保护性免疫形成之前,可使用抗病毒药物在爆发期间提供快速保护并减少 FMDV 的传播。最近,我们建议将具有佐剂作用的抗病毒药物与 FMD 灭活疫苗联合使用,以实现早期保护和增强疫苗免疫。建议的抗病毒药物是长效猪干扰素(IFN)-α和I型IFN诱导剂,如槲皮素。我们观察到I型IFN和IFN诱导剂在体内能有效增强免疫力并抑制 FMDV 复制。最近,我们建议将具有佐剂作用的抗病毒药物与 FMD 灭活疫苗联合使用,以实现早期保护和增强疫苗免疫。建议的抗病毒药物为持续时间改善的猪干扰素(IFN)-α 和 I 型 IFN 诱导剂,如槲皮素。我们观察到I型IFN和IFN诱导剂在体内能有效增强免疫力并抑制FMDV复制。我们开发了一种重组腺病毒,可同时表达三种靶向 FMDV非结构蛋白区域的三种短发夹RNA(shRNA),其中Ad-3siRNA能诱导快速(在感染后6小时内)且有效的FMDV抑制。通过利用5型人腺病毒递送载体,它可直接应用于包括小鼠和猪在内的多种宿主。我们建议通过联合使用 siRNA和I型IFN以产生快速起效且持久的保护力从而控制猪群中FMD。然而,我们并不排除Ad-3siRNA作为IFN诱导剂的潜力,因为除了一些isiRNA报道之外,还有关于Ad-3siRNA可刺激猪细胞中的干扰素刺激基因(ISG)的报告。在此,我们研究了Ad-3siRNA与FMD灭活疫苗联合使用的免疫刺激效果,重点关注猪细胞中I型IFN的产生和 ISG 的表达,以及Ad-3siRNA与FMD疫苗联合使用在小鼠和猪中诱导的中和抗体滴度。2. 材料和方法2.1 细胞和病毒人胚胎肾(HEK)293细胞:在含4mM L-谷氨酰胺的293无血清培养基中培养,置于37°C、5%CO₂培养箱中。猪肾(IBRS-2和LFBK)细胞使用添加10%胎牛血清(FBS,pH7.4)的DMEM培养基在37℃、5%CO2培养箱中进行培养。表达5型人腺病毒E1 DNA的HEK293细胞用于扩增重组腺病毒和进行腺病毒滴度测定。IBRS-2 细胞用于测试干扰素和 ISG 诱导。LFBK细胞用于病毒中和试验和FMDV滴度测定。表达多种靶向 FMDV 的 siRNA的重组腺病毒(Ad-3siRNA)和重组腺病毒阴性对照(Ad-null control)由我们实验室建立。三种shRNA靶向FMDV基因组的高度保守的2B和3C区域(图 1A)。腺病毒DNA包含三个U6启动子、shRNA 编码序列(2B、3C2和 3C1 shRNA)以及含六个胸苷的pol III 转录终止子(图 1B)。韩国FMDV分离株O/SKR/Boeun/2017(GenBank登录号MG983730)用于评估抗病毒效果,FMDV A/SKR/Yeoncheon/2017(GenBank登录号KR766148)用于病毒中和抗体检测。使用Karber法测定和计算病毒滴度(Ramakrishnan,2016)。图1. Ad-3siRNA示意图。(A)口蹄疫病毒全基因组示意图。黑色箭头表示shRNA的靶区域。(B)Ad-3siRNA的构建。腺病毒DNA含有三个U6启动子、shRNA编码序列(2B、3C 2和3C 1 shRNA)和pol III转录终止子。2.2 I型干扰素蛋白检测将 IBRS-2细胞(3×10⁵个细胞/孔)接种到 24 孔板中。次日,用50感染复数(MOI)的Ad-3siRNA或Ad-null control感染细胞,在37°C下孵育。感染后2小时用新鲜培养基更换培养基后,将细胞在37°C下孵育。在8、24和48小时收集上清液,使用猪 IFN-α 酶联免疫吸附测定(ELISA)试剂盒和猪 IFN-β ELISA 试剂盒测量上清液中的猪 IFN-α 和 IFN-β 水平。2.3 干扰素测定如前所述,通过基于 FMDV 的 IFN 测定分析 24 和 48 小时收集上清液的抗病毒活性。简而言之,将 LFBK 细胞在 96 孔板中培养至90%。然后加入两倍稀释的上清液。24小时后,移除上清液,每孔用250 TCID50的FMDV 感染 1小时,并在 37°C下孵育 48 小时。在诱导 50%细胞病变效应(CPE)抑制的最高稀释度下测量抗FMDV的抗病毒活性(单位)。2.4 动物实验7 周龄雌性C57BL/6小鼠,BALB/c小鼠,FMDV中和抗体阴性(中和抗体滴度2.4.1 小鼠保护作用分析C57BL/6小鼠(每组5只)在攻毒前1天或7天通过肌内注射 FMD 疫苗、Ad-3siRNA 或 Ad-null control 的组合(3×10⁸ TCID50/dose)或PBS,以评估对FMDV的保护作用。FMD 灭活疫苗由A/SKR/Yeoncheon/2017的FMD疫苗抗原(0.25 μg /dose)、10%氢氧化铝凝胶和Montanide ISA 206配制而成。通过腹腔注射250LD50的小鼠适应型 FMDV A/Malaysia/97攻击小鼠。在攻击后8天内监测小鼠的存活率。2.4.2 小鼠体液免疫测定(短期)为分析接种后三周的中和抗体水平,使用C57BL/6小鼠(每组5只),通过肌内注射FMD疫苗、Ad-3siRNA或Ad-null control(3×10⁸ TCID50/dose)的组合或PBS。FMD 灭活疫苗使用A/SKR/Yeoncheon/2017 的疫苗抗原(1μg/头份)、10% 氢氧化铝凝胶和 Montanide ISA 206配制而成。在接种后1、2和3周采血分离血清。2.4.3 猪体液免疫测定(长期)为长期分析抗体水平,对猪(每组4只)通过肌内注射FMD疫苗、疫苗和Ad-3siRNA 的组合或Ad-null control(1×10¹⁰TCID50/头份),不进行加强免疫。在 1、3、5和7周采血分离血清。2.4.4 病毒中和试验(VNT)小鼠和猪血清在56℃下热灭活30 min备用,按照《陆生动物诊断测试和疫苗手册》(WOAH,2022)指南进行病毒中和试验。在LFBK细胞中传代四次的 FMDV A/SKR/Yeoncheon/2017用于VNT。2.4.5 小鼠中细胞因子测定如前所述进行小鼠细胞因子测定。每组4只BALB/c小鼠通过腹腔注射 0.1mL的Ad-3siRNA或Ad-null control(3×10⁸ TCID50/dose)。在接种后0、16、24和48小时采血分离血清,血清用于使用小鼠 IFN-α、IFN-γ、IL-12、IL-6、IL-15和 IL-18 ELISA试剂盒测量 IFN-α、IFN-γ、IL-12、IL-6、IL-15 和 IL-18 的浓度。通过标准曲线插值确定蛋白质浓度。2.5 猪细胞的逆转录-定量PCR(RT-qPCR)分析将 IBRS-2 细胞(1×106个细胞/孔)接种到6孔板中,用50MOI的Ad-3siRNA 或 Ad-null control感染,并在 37°C 下孵育。在24和48小时收集细胞。如前所述进行 RNA 提取、DNase I处理和RT-qPCR。RT-qPCR检测2'-5' OAS、PKR 和 Mx mRNA的ISG 表达分析以及RLR信号相关基因RIG-I、MDA-5和核因子 κB 激酶ε抑制剂(IKKε)的表达。猪甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH)用作内参。2.6 统计分析使用GraphPad Prism进行非配对t检验。3. 结果3.1 Ad-3siRNA对猪细胞I型干扰素的诱导作用测量用 Ad-3siRNA 或 Ad-null control 处理的猪细胞上清液中的IFN蛋白水平和抗病毒活性。与Ad-null control感染的细胞上清液相比,在Ad-3siRNA感染的细胞上清液中,24小时感染后检测到更高水平的猪IFN-α蛋白(图2A,P图2.检测用Ad-3siRNA感染的猪细胞的上清液中的I型IFN(A)猪IFN-α蛋白水平、(B)IFN-β蛋白的水平、(C)使用Ad 3siRNA感染的猪细胞的上清液测量抗FMDV活性3.2.Ad-3siRNA 与 FMD 疫苗联合在小鼠中引发早期保护和增强的中和抗体水平为测试Ad-3siRNA与FMD疫苗在接种后1周内的保护效果,监测接种疫苗和Ad-3siRNA的小鼠的存活率(图3A和B)。与PBS组小鼠相比,注射疫苗、疫苗+Ad-null control或疫苗+Ad-3siRNA的小鼠存活率更高。然而,接种后1或7天,疫苗+Ad-3siRNA组的存活率(100%)均显著高于疫苗组或疫苗+Ad-null control 组。为评估Ad-3siRNA在接种早期对体液免疫的影响,测量了免疫后3周的中和抗体滴度(VN 滴度)(图 3C)。疫苗+ Ad-3siRNA组在接种后1、2和3周的VN滴度均高于疫苗组或疫苗+ Ad-null control组(P图3. 小鼠生存曲线和中和抗体水平(A)在FMDV感染前1天小鼠生存曲线,(B)在FMDV感染前7天小鼠生存曲线(C)血清中和抗体试验结果。虚线表示1:32(log 10 1.5)病毒中和滴度临界水平。3.3 Ad-3siRNA与口蹄疫疫苗联合应用增强猪体液免疫情况为评估Ad-3siRNA 对自然宿主体液免疫的持续影响,给猪单次注射疫苗或疫苗与Ad-3siRNA(或 Ad-null control)的组合,监测免疫后7周中和抗体滴度(图 4)。疫苗+Ad-3siRNA 组在免疫后第3、5和7周的VN滴度高于疫苗组或疫苗+ Ad-null control组(P图4.猪中病毒中和抗体水平3.4 ISG和RLR的上调测量用Ad-3siRNA或Ad-null control 处理的猪细胞中ISG(如寡腺苷酸合成酶(OAS)、粘液病毒抗性(Mx)和 PKR)的mRNA水平。与Ad-null control感染或未处理的细胞相比,Ad-3siRNA感染的细胞中观察到显著升高(P图5. Ad-3 siRNA上调猪细胞干扰素刺激基因和RIG-I样受体信号相关基因表达3.5 Ad-3siRNA 在小鼠中诱导细胞因子为分析Ad-3siRNA在体内诱导的细胞因子,测量腹腔注射Ad-3siRNA的小鼠血清样本中的细胞因子水平。与接种Ad-null control的小鼠相比,注射Ad 3siRNA的小鼠在16-48小时内的IFN-α、IFN-γ、IL-12、IL-6、IL-15和IL-18水平显著升高(图6,P 图6. Ad-3siRNA 在小鼠中诱导细胞因子4. 讨论SiRNA可用于安全快速的抗病毒治疗策略中。然而,外源性siRNA的作用持续时间短,并且靶病毒可进化出抗性机制以避开 siRNA。在某些情况下,siRNA诱导先天免疫,从而影响其疗效。然而,免疫激活可能有利于控制病毒感染,isiRNA可能促进长期和广谱的抗病毒作用。在本研究中,我们提出表达多种抗 FMDV siRNA的重组腺病毒(Ad-3siRNA)作为一种新型免疫调节剂,它可诱导包括I型IFN在内的多种细胞因子,并与 FMD 疫苗联合使用时具有佐剂作用。Ad-3siRNA旨在抑制多种血清型的 FMDV。Ad-3siRNA 是一种直接作用的 FMDV抑制剂,这也是其作用迅速的原因。靶区域是2B和3C基因,已知它们是FMDV基因组中最保守的区域。我们先前观察到仅注射Ad-3siRNA的乳鼠对FMDV有保护作用(7天存活率约90%)。这种抑制可能是由于多种siRNA的基因沉默,而非免疫调节导致,因为乳鼠没有包括先天免疫在内的成熟的免疫系统。此外,由于半衰期短,进行了三次Ad-3siRNA注射。有鉴于此,我们采用Ad-3siRNA与I型IFN(猪IFN-α)联合使用,以克服siRNA的缺点,如作用时间短和因病毒突变而降低效力。I型IFN(或IFN诱导剂)通过增强抗病毒作用和体液免疫,可能是一种有前景的快速有效保护策略。在本研究中,我们清楚地表明Ad-3siRNA在体外和体内诱导I型IFN,因此可有效用作FMD疫苗佐剂。Ad-3siRNA与FMD疫苗联合使用时,除了增强体内中和抗体的产生外,还刺激了多种细胞因子的产生,如I型IFN、IFN-γ、IL-12、IL-15、IL-6和IL-18。据报道,IFN-α为FMD疫苗的有效佐剂。此外,IFN-γ、IL-12 和 IL-15 参与 T 细胞免疫并对病毒复制产生抑制作用。IL-18刺激B细胞增殖、IFN-γ产生和辅助性T细胞2(Th2)反应。IL-6也是B细胞活化的关键细胞因子。尽管Ad-3siRNA诱导细胞因子,但我们在实验小鼠和猪中未观察到副作用。在我们的小鼠实验中未观察到体重减轻、异常运动或死亡。在猪实验中,我们同时使用Ad-3siRNA和FMD疫苗,也未观察到死亡、异常运动或皮疹。注射I型IFN或IFN诱导剂的动物通常会出现暂时性体温升高。然而,这种症状通常在1到2天内消失,并且在Ad-3siRNA组中不明显。Ad-3siRNA 的佐剂有效性和安全性是剂量依赖性的,应在猪中进行实际应用测试。除佐剂作用外,Ad-3siRNA诱导I型IFN在控制病毒方面可能具有优势。(1)我们认为Ad-3siRNA 的抗病毒作用可能通过其免疫调节作用介导。I型IFN是对抗FMDV产生的最有效的抗病毒蛋白之一。此外,我们观察到小鼠对FMDV的保护作用(100% 存活率)在注射后7天得以维持。I型IFN广泛抑制病毒复制并刺激免疫细胞,包括树突状细胞、B细胞和T细胞。(2)尽管Ad-3siRNA最初被开发为一种仅靶向FMDV的siRNA,但我们观察到它具有广泛的抗病毒效果,不仅限于FMDV,还针对BEV和PRRSV。众所周知,I型IFN对多种病毒具有抗病毒作用。在不同种属(如猪、牛和猴)的细胞中观察到这些效应。除了诱导小鼠IFN-α和IFN-β外,还在猪细胞中也诱导猪IFN-α和IFN-β。此外,本研究中使用的人腺病毒载体具有广泛的宿主范围,包括猪和牛。已有几项使用5型人腺病毒载体控制FMDV的研究报道。因此,我们认为Ad-3siRNA可用于不同动物体内抗多种病毒的研究。人腺病毒5型在 HEK293细胞中产生。可产生高滴度的重组腺病毒(10¹¹⁻¹² pfu/mL),并且在 HEK293细胞中可进行悬浮培养。我们认为,由于Ad-3siRNA 在293细胞中不产生蛋白质,因此在家畜中的应用不需要特殊的纯化过程。我们使用CRISPR Cas-9技术开发了IFNAR KO 293悬浮细胞系,并且在这些细胞系中获得更高滴度的重组腺病毒。因此,我们认为,对于5型腺病毒载体的应用,成本不会是一个重大问题。实际生产成本取决于公司的生产效率。此外,应考虑家畜的效果和成本来确定最佳剂量。Ad-3siRNA的免疫刺激作用机制尚不清楚。一种可能性是Ad-3siRNA可通过 RIG-I和(或)MDA-5信号传导诱导先天免疫。RLRs是检测病原体相关分子模式并启动包括I型IFN表达在内的抗病毒反应的细胞质 dsRNA传感器。RLRs包括MDA-5、RIG-I和遗传学与生理学实验室 2(LGP2)。其中,MDA-5和RIG-I与病毒RNA的结合触发信号级联以诱导I型IFN表达。我们观察到,尽管在RIG-I敲除细胞和对照细胞中OAS的mRNA水平上调,但在MDA-5敲除细胞中未增强(图S1)。还表明Ad-3siRNA可能是RIG-I和MDA-5的双重激动剂,可上调RIG-I、MDA-5和IKKε的表达。在基因设计方面,我们认为使用多个shRNA和U6(Pol III)启动子表达shRNA可能是Ad-3siRNA诱导I型IFN的关键因素。先前的研究也报道,与 Pol II 启动子相比,具有 U6(RNA 聚合酶III)启动子表达 shRNA 的病毒载体更可能诱导 IFN。此外,观察到与三种shRNA不同,用表达由U6启动子驱动的单个shRNA的腺病毒处理的细胞中,ISG mRNA没有上调。因此,有必要详细研究Ad-3siRNA引发的IFN信号传导机制。总之,我们的研究表明,通过人腺病毒载体递送的新型免疫刺激RNA Ad-3siRNA是一种有前景的佐剂,它可诱导多种细胞因子并通过刺激中和抗体产生来增强FMD疫苗的效果。因此,Ad-3siRNA与疫苗联合使用可能更有效地预防FMD的传播。未来,应探索Ad-3siRNA在不同动物的多种病毒性疾病中的应用,并进行详细的机制研究。
2025-09-30 11:48:13
非洲猪瘟(African swine fever, ASF)被世界动物卫生组织(WOAH)列为法定报告的动物疫病,是危害世界养猪业的“头号杀手”。自2018年以来,ASF疫情给我国养猪产业造成直接经济损失超过10 000亿元,严重影响肉食品供应、国际贸易以及社会经济稳定。目前,由于没有安全、有效的商品化疫苗用于ASF的防控,我国ASF疫情依然严峻复杂,其持续存在是制约我国养猪业健康发展的瓶颈。非洲猪瘟病毒(African swine fever virus, ASFV)基因组庞大,目前不仅许多基因未注释,已注释的基因中也有约50%的基因功能未知。由于人们对ASFV的感染与致病机制的认知有限,制约了安全、高效的 ASFV疫苗的研发。制备ASFV蛋白抗体,将为研究ASFV蛋白功能提供生物材料,对于阐明ASFV的感染与致病机制具有重要意义。近期,中国农业科学院哈尔滨兽医研究所基础免疫创新团队完成的题为“非洲猪瘟病毒pD345L蛋白单克隆抗体的制备及其表位鉴定”的研究在《中国农业科学》2025年第58卷16期正式发表。该研究构建pET-28a-D345L重组原核表达质粒,将其转化大肠杆菌BL21(DE3)感受态细胞,表达并用亲和层析方法纯化重组的pD345L蛋白(rpD345L)。将纯化的rpD345L与等体积的弗氏完全佐剂乳化后免疫5周龄SPF级BALB/c小鼠,每隔两周免疫一次,共免疫3次。第二次和第三次免疫均用弗氏不完全佐剂乳化。第三次免疫一周后通过小鼠颌下静脉采血,分离血清,利用ELISA方法检测血清抗体效价,选取抗体效价高的小鼠加强免疫。免疫3 d后取小鼠脾细胞与小鼠骨髓瘤细胞(SP2/0)进行融合。将重组GST-pD345L作为包被抗原,利用ELISA方法筛选阳性杂交瘤细胞,经过3次筛选得到能够稳定分泌pD345L mAbs的杂交瘤细胞株,注入小鼠腹腔制备腹水。使用单抗亚类鉴定试剂盒鉴定mAbs的重、轻链类型。利用外源过表达的pD345L和ASFV HLJ/18株感染的猪肺泡巨噬细胞(PAMs)为抗原,用制备的mAbs作为一抗,分别进行Western blot和间接免疫荧光(IFA)鉴定。随后将截短的pD345L与GST融合表达,用筛选的mAbs鉴定抗原表位,分析鉴定的抗原表位在不同ASFV毒株中的保守性。结果表明,IPTG诱导后,pD345L以包涵体形式表达,分子量为40.5 kDa。将其免疫BALB/c小鼠后经间接ELISA方法筛选得到2株稳定分泌pD345L mAbs的杂交瘤细胞株,命名为10H3和5G1。His-rpD345L的SDS-PAGE及Western blot鉴定亚类鉴定结果显示,2株mAbs重链类型均为IgG1型,轻链类型为κ链,抗体效价为1:1 638 400。pD345L mAbs的亚类鉴定及腹水效价检测Western blot和IFA结果显示,制备的mAbs均能识别天然表达的pD345L。经Western blot确定抗原表位,结果显示10H3和5G1 mAbs的最小线性B细胞表位分别为1METFVRLFKD10和321YEKICCSEES330,这两个抗原表位在ASFV不同毒株中具有保守性。抗pD345L mAbs识别pD345L的Western blot检测pD345L mAbs识别pD345L的IFA检测Western blot鉴定pD345L mAbs识别的抗原表位综上,本研究原核表达并纯化了rpD345L,制备了2株pD345L mAbs,并鉴定了其识别的抗原表位,且这2株mAbs均能有效识别ASFV感染过程中表达的pD345L,为进一步研究ASFV pD345L功能奠定基础。中国农业科学院哈尔滨兽医研究所黄丽研究员为该文通讯作者,贺筱萍为第一作者。该研究获得国家自然科学基金(32322081,32270156)、中国农业科学院科学中心项目(CAAS-CSLPDCP-202401,CAAS-CSLPDCP-2023002)的资助。全文链接:《非洲猪瘟病毒pD345L蛋白单克隆抗体的制备及其表位鉴定》贺筱萍, 张元峰, 刘学敏, 黄丽, 翁长江. 非洲猪瘟病毒pD345L蛋白单克隆抗体的制备及其表位鉴定[J]. 中国农业科学, 2025, 58(16): 3345-3356.HE XiaoPing, ZHANG YuanFeng, LIU XueMin, HUANG Li, WENG ChangJiang. Preparation of Monoclonal Antibody Against African Swine Fever Virus pD345L Protein and Identification of Its Epitope[J]. Scientia Agricultura Sinica, 2025, 58(16): 3345-3356.
2025-09-28 16:14:09